Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms