Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX1T1Q06455 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms