Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK2Q05397 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms