Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCQQ04759 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCQQ04759 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms