Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAP1Q03518 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms