Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB1Q02641 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB1Q02641 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms