Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSC2Q02487 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DSC2Q02487 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms