Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP3Q02447 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP3Q02447 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP3Q02447 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP3Q02447 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SP3Q02447 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SP3Q02447 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP3Q02447 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP3Q02447 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP3Q02447 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP3Q02447 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP3Q02447 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP3Q02447 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP3Q02447 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP3Q02447 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP3Q02447 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP3Q02447 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP3Q02447 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP3Q02447 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP3Q02447 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP3Q02447 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP3Q02447 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP3Q02447 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP3Q02447 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP3Q02447 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP3Q02447 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP3Q02447 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP3Q02447 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP3Q02447 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP3Q02447 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SP3Q02447 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SP3Q02447 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP3Q02447 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms