Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROR1Q01973 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms