Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIBQ01892 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms