Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK16Q00536 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms