Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARF1P84077 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF1P84077 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF1P84077 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF1P84077 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF1P84077 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF1P84077 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF1P84077 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF1P84077 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF1P84077 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF1P84077 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF1P84077 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF1P84077 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF1P84077 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF1P84077 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF1P84077 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF1P84077 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms