Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPS25P82663 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS25P82663 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS25P82663 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS25P82663 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS25P82663 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS25P82663 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms