Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CRB1P82279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CRB1P82279 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CRB1P82279 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CRB1P82279 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRB1P82279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CRB1P82279 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRB1P82279 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRB1P82279 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CRB1P82279 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRB1P82279 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CRB1P82279 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRB1P82279 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRB1P82279 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CRB1P82279 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CRB1P82279 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CRB1P82279 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRB1P82279 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CRB1P82279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRB1P82279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRB1P82279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRB1P82279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRB1P82279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRB1P82279 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRB1P82279 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CRB1P82279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRB1P82279 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRB1P82279 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRB1P82279 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CRB1P82279 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRB1P82279 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRB1P82279 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CRB1P82279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CRB1P82279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CRB1P82279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRB1P82279 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRB1P82279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CRB1P82279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRB1P82279 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRB1P82279 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRB1P82279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CRB1P82279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CRB1P82279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRB1P82279 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRB1P82279 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CRB1P82279 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CRB1P82279 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CRB1P82279 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CRB1P82279 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CRB1P82279 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CRB1P82279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CRB1P82279 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRB1P82279 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CRB1P82279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CRB1P82279 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CRB1P82279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRB1P82279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 833.1 ms