Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNA1P78396 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA1P78396 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCNA1P78396 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms