Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP1P78357 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms