Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HBBP68871 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HBBP68871 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HBBP68871 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HBBP68871 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HBBP68871 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HBBP68871 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HBBP68871 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HBBP68871 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HBBP68871 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HBBP68871 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HBBP68871 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HBBP68871 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HBBP68871 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HBBP68871 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms