Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2BP67870 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2BP67870 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms