Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO1P63165 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms