Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMA6P60900 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA6P60900 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms