Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERVPABLB-1P60509 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms