Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN6P56747 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN6P56747 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN6P56747 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms