Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRP1P56182 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRP1P56182 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRP1P56182 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRP1P56182 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRP1P56182 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRP1P56182 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRP1P56182 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRP1P56182 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRP1P56182 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRP1P56182 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP1P56182 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP1P56182 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP1P56182 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP1P56182 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP1P56182 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP1P56182 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRP1P56182 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRP1P56182 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRP1P56182 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RRP1P56182 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRP1P56182 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRP1P56182 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRP1P56182 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRP1P56182 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRP1P56182 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRP1P56182 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRP1P56182 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRP1P56182 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRP1P56182 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRP1P56182 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRP1P56182 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RRP1P56182 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRP1P56182 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRP1P56182 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRP1P56182 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRP1P56182 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRP1P56182 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRP1P56182 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRP1P56182 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP1P56182 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP1P56182 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP1P56182 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP1P56182 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP1P56182 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP1P56182 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP1P56182 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP1P56182 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP1P56182 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP1P56182 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms