Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ATP1B3P54709 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1B3P54709 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms