Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATXN3P54252 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms