Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPAP49450 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPAP49450 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPAP49450 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPAP49450 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPAP49450 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPAP49450 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPAP49450 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPAP49450 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPAP49450 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPAP49450 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPAP49450 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPAP49450 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPAP49450 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CENPAP49450 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CENPAP49450 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPAP49450 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPAP49450 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPAP49450 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPAP49450 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPAP49450 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPAP49450 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPAP49450 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms