Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT6CP48668 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6CP48668 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6CP48668 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms