Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms