Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ1P48048 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNJ1P48048 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNJ1P48048 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms