Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSN1S1P47710 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms