Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR2P43308 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR2P43308 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR2P43308 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR2P43308 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR2P43308 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR2P43308 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR2P43308 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR2P43308 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR2P43308 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR2P43308 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR2P43308 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR2P43308 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR2P43308 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR2P43308 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR2P43308 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR2P43308 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR2P43308 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR2P43308 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR2P43308 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR2P43308 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR2P43308 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR2P43308 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR2P43308 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR2P43308 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR2P43308 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR2P43308 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR2P43308 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR2P43308 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR2P43308 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR2P43308 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR2P43308 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR2P43308 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR2P43308 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR2P43308 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR2P43308 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR2P43308 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR2P43308 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR2P43308 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR2P43308 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR2P43308 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR2P43308 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR2P43308 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR2P43308 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR2P43308 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms