Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms