Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 YIF1B-205ENST00000585563 1118 ntTSL 319.54■□□□□ 0.727e-10■■■■■ 40.8
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GTF2F1P35269 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.517e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-207ENST00000587039 466 ntTSL 517.27■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.317e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.257e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-211ENST00000589247 734 ntTSL 216.03■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.046e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.726e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-224ENST00000593241 535 ntTSL 320.96■□□□□ 0.959e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-207ENST00000587181 534 ntTSL 418.94■□□□□ 0.629e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-223ENST00000592883 589 ntTSL 417.61■□□□□ 0.419e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.49e-11■■■■■ 40.8
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GTF2F1P35269 RFX2-218ENST00000592172 573 ntTSL 415.92■□□□□ 0.149e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-205ENST00000586806 537 ntTSL 315.31■□□□□ 0.049e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-206ENST00000586940 787 ntTSL 314.49□□□□□ -0.099e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-208ENST00000587321 337 ntTSL 314.32□□□□□ -0.129e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-221ENST00000592473 577 ntTSL 413.56□□□□□ -0.249e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-215ENST00000589742 565 ntTSL 412.93□□□□□ -0.349e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 RFX2-201ENST00000303657 3993 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.49e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 KIAA0355-204ENST00000588470 632 ntTSL 518.02■□□□□ 0.487e-9■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 KIAA0355-206ENST00000589583 582 ntTSL 317.93■□□□□ 0.467e-9■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 KIAA0355-203ENST00000588338 561 ntTSL 510.44□□□□□ -0.747e-9■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-208ENST00000452206 1059 ntTSL 515.28■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-204ENST00000410110 1075 ntTSL 511.15□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-212ENST00000464483 530 ntTSL 211.11□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-210ENST00000460660 265 ntTSL 1 (best)8.41□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 BZW1-207ENST00000450637 578 ntTSL 47.99□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 40.7
GTF2F1P35269 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.766e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.496e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 METRN-203ENST00000567076 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.12■■□□□ 1.936e-10■■■■■ 40.6
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GTF2F1P35269 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.846e-10■■■■■ 40.6
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GTF2F1P35269 C1QTNF12-203ENST00000468365 647 ntTSL 323.59■■□□□ 1.376e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.366e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.236e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-223ENST00000523270 575 ntTSL 422.67■■□□□ 1.226e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PPP1R16A-210ENST00000533088 577 ntTSL 222.46■■□□□ 1.196e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 METRN-202ENST00000564661 1174 ntTSL 1 (best)22.17■■□□□ 1.146e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.086e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 KRT19-202ENST00000455635 641 ntTSL 320.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 220.94■□□□□ 0.946e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.946e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-215ENST00000521174 485 ntTSL 520.69■□□□□ 0.96e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.816e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 519.59■□□□□ 0.736e-10■■■■■ 40.6
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GTF2F1P35269 TXNRD2-213ENST00000487165 2020 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.716e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.716e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 DPM2-205ENST00000495270 1662 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.696e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.666e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-219ENST00000634471 748 ntTSL 318.79■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-207ENST00000462843 810 ntTSL 318.79■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 40.6
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GTF2F1P35269 CNOT8-205ENST00000518028 516 ntTSL 418.73■□□□□ 0.596e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-211ENST00000519430 562 ntTSL 418.73■□□□□ 0.596e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.587e-8■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 ZNF767P-204ENST00000486492 1616 ntTSL 218.5■□□□□ 0.556e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.557e-8■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.547e-8■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.546e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.537e-8■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-221ENST00000522458 623 ntTSL 418.07■□□□□ 0.486e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.486e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.466e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-206ENST00000518775 920 ntTSL 517.67■□□□□ 0.426e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PPP1R16A-203ENST00000526183 4311 ntTSL 217.5■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.356e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.336e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-208ENST00000519211 620 ntTSL 317.09■□□□□ 0.336e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-222ENST00000522644 1027 ntTSL 516.76■□□□□ 0.276e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-216ENST00000495655 2700 ntTSL 216.23■□□□□ 0.196e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-203ENST00000517568 692 ntTSL 415.82■□□□□ 0.126e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-207ENST00000518782 550 ntTSL 415.82■□□□□ 0.126e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-209ENST00000519394 500 ntTSL 315.12■□□□□ 0.016e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-219ENST00000521729 1068 ntTSL 215.12■□□□□ 0.016e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 DPM2-203ENST00000470181 928 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -06e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-212ENST00000519903 648 ntTSL 414.66□□□□□ -0.066e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 DPM2-204ENST00000473360 744 ntTSL 514.58□□□□□ -0.086e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 411.93□□□□□ -0.51e-13■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 49.01□□□□□ -0.971e-13■■■■■ 40.6
GTF2F1P35269 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 523.77■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 40.5
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