Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTR2AP28223 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2AP28223 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms