Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX3P26022 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX3P26022 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX3P26022 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX3P26022 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX3P26022 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX3P26022 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX3P26022 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX3P26022 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX3P26022 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX3P26022 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTX3P26022 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX3P26022 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX3P26022 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX3P26022 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX3P26022 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX3P26022 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX3P26022 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTX3P26022 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTX3P26022 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTX3P26022 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTX3P26022 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTX3P26022 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTX3P26022 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTX3P26022 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTX3P26022 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms