Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND1P24385 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND1P24385 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND1P24385 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND1P24385 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND1P24385 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND1P24385 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND1P24385 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND1P24385 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND1P24385 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND1P24385 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND1P24385 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND1P24385 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND1P24385 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND1P24385 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND1P24385 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND1P24385 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND1P24385 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND1P24385 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND1P24385 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND1P24385 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND1P24385 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.6 ms