Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP100P23497 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP100P23497 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP100P23497 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP100P23497 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP100P23497 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SP100P23497 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP100P23497 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP100P23497 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP100P23497 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP100P23497 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP100P23497 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SP100P23497 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP100P23497 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP100P23497 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP100P23497 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP100P23497 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SP100P23497 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP100P23497 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP100P23497 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP100P23497 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP100P23497 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP100P23497 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP100P23497 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP100P23497 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP100P23497 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP100P23497 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP100P23497 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP100P23497 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP100P23497 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP100P23497 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP100P23497 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP100P23497 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms