Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMPD1P23109 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
AMPD1P23109 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMPD1P23109 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMPD1P23109 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMPD1P23109 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMPD1P23109 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMPD1P23109 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMPD1P23109 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms