Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNA2P20248 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms