Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFEBP19484 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFEBP19484 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFEBP19484 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFEBP19484 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFEBP19484 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFEBP19484 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFEBP19484 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFEBP19484 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFEBP19484 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFEBP19484 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFEBP19484 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFEBP19484 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFEBP19484 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TFEBP19484 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TFEBP19484 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFEBP19484 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFEBP19484 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFEBP19484 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFEBP19484 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFEBP19484 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFEBP19484 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFEBP19484 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFEBP19484 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms