Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATF3P18847 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATF3P18847 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF3P18847 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF3P18847 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF3P18847 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF3P18847 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF3P18847 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF3P18847 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF3P18847 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF3P18847 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF3P18847 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF3P18847 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF3P18847 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF3P18847 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATF3P18847 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATF3P18847 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATF3P18847 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATF3P18847 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATF3P18847 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATF3P18847 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATF3P18847 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATF3P18847 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATF3P18847 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATF3P18847 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATF3P18847 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATF3P18847 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATF3P18847 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATF3P18847 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATF3P18847 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATF3P18847 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATF3P18847 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATF3P18847 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATF3P18847 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF3P18847 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATF3P18847 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATF3P18847 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATF3P18847 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATF3P18847 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATF3P18847 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATF3P18847 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATF3P18847 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATF3P18847 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATF3P18847 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATF3P18847 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATF3P18847 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATF3P18847 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms