Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB42P16452 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB42P16452 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB42P16452 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB42P16452 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB42P16452 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB42P16452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB42P16452 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB42P16452 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB42P16452 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB42P16452 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB42P16452 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB42P16452 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB42P16452 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB42P16452 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB42P16452 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB42P16452 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB42P16452 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB42P16452 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB42P16452 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB42P16452 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB42P16452 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB42P16452 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB42P16452 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPB42P16452 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPB42P16452 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB42P16452 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms