Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPCAMP16422 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms