Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NID1P14543 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NID1P14543 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NID1P14543 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NID1P14543 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NID1P14543 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NID1P14543 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NID1P14543 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NID1P14543 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NID1P14543 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NID1P14543 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NID1P14543 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NID1P14543 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NID1P14543 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NID1P14543 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NID1P14543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NID1P14543 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NID1P14543 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NID1P14543 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NID1P14543 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NID1P14543 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NID1P14543 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NID1P14543 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NID1P14543 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NID1P14543 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NID1P14543 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms