Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFAPP14136 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFAPP14136 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GFAPP14136 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFAPP14136 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFAPP14136 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFAPP14136 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFAPP14136 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFAPP14136 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms