Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms