Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK4P11802 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK4P11802 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK4P11802 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK4P11802 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK4P11802 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK4P11802 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK4P11802 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK4P11802 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK4P11802 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK4P11802 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK4P11802 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK4P11802 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK4P11802 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK4P11802 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK4P11802 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK4P11802 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK4P11802 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK4P11802 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK4P11802 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK4P11802 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK4P11802 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK4P11802 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK4P11802 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK4P11802 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms