Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C9P11712 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP2C9P11712 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP2C9P11712 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms