Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAR1AP10644 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1AP10644 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAR1AP10644 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAR1AP10644 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms