Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HKR1P10072 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HKR1P10072 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HKR1P10072 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HKR1P10072 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HKR1P10072 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HKR1P10072 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HKR1P10072 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HKR1P10072 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HKR1P10072 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms